Kabupaten Nunukan ialah salah satu kabupaten di Kalimantan Utara, Indonesia. Ibu kota kabupaten ini terletak di Nunukan. Kabupaten ini mempunyai luas wilayah 14.493 km² dan berpenduduk sebanyak 140.842 jiwa (hasil Sensus Penduduk Indonesia 2010). Motto Kabupaten Nunukan ialah "Penekindidebaya" yang artinya "Membangun Daerah" yang berasal dari bahasa Tidung. Nunukan juga ialah nama sebuah kecamatan di kabupaten ini.
Peta Kabupaten Nunukan
Letak astronomi Koordinat: 3°30'00" - 4°24'55" LU dan 115°22'30" - 118°44'54" BT.
Pelabuhan Nunukan ialah pelabuhan lintas dengan kota Tawau, Malaysia. Bagi penduduk kota Nunukan yang hendak pergi ke Tawau dibutuhkan dokumen PLB (Pas Lintas Batas). Setiap hari rata-rata sekitar 8 unit kapal cepat dengan kapasitas kurang lebih 100 orang mondar-mandir antar Nunukan dengan Tawau, Malaysia.
Kabupaten Nunukan ialah wilayah pemekaran dari Kabupaten Bulungan, Kalimantan Utara. Pembentukan kabupaten ini menurut pertimbangan luas wilyah, peningkatan pembangunan, dan peningkatan pelayanan kepada masyarakat. melaluiataubersamaini dasar inilah dilakukan pemekaran pada Kabupaten Bulungan menjadi 2 kabupaten gres lainnya, yaitu Kabupaten Nunukan dan Kabupaten Malinau.